(資料圖片)

哥倫比亞工程學院和哥倫比亞大學歐文醫(yī)學中心的研究人員發(fā)明了一種新的 RNA 測序方法，可以從少量冷凍腫瘤標本中獲得高質(zhì)量的結果。他們在兩項臨床研究中展示了他們的技術的成功，這些研究分析了數(shù)十個腫瘤樣本，包括存檔的和新收集的樣本，以了解它們對抗腫瘤治療的反應。該論文于 2023 年 1 月 9 日由Nature Genetics發(fā)表。

在過去十年中，使用 RNA 測序以單細胞分辨率測量基因表達一直是研究癌組織最具變革性的工具之一。通過檢查單個細胞的 RNA，研究人員可以更好地了解腫瘤內(nèi)細胞的多樣性，以及這些腫瘤細胞如何生長以及如何與免疫細胞相互作用。這些是了解癌癥進展的標志和癌癥對治療的抵抗力的重要因素——這兩者都是開發(fā)新的癌癥治療方法的關鍵。

在傳統(tǒng)臨床工作流程中廣泛采用單細胞 RNA 測序的一個主要障礙是所需的新鮮組織的體積——遠遠超過為臨床目的常規(guī)收集的組織。對新鮮組織的需求意味著一旦收集到樣本就必須立即進行分析。這些要求極大地限制了可以對患者樣本進行的科學分析。

成功的新技術

哥倫比亞團隊專注于克服這些障礙，創(chuàng)造了一種新的測序方法，可以從少量冷凍腫瘤標本中獲得最佳結果。通常在臨床試驗期間收集并儲存在生物庫中，這些標本可能包括來自罕見癌癥和具有獨特病史或風險因素的患者的組織。新技術對這些類型的標本進行測序的能力極大地增加了可用于科學分析的腫瘤樣本的數(shù)量和種類。

“我們對這項工作及其潛力感到非常興奮，”歐文癌癥動力學研究所生物醫(yī)學工程助理教授、赫伯特和佛羅倫薩歐文癌癥數(shù)據(jù)研究助理教授 Elham Azizi 說，他與本杰明伊扎爾共同監(jiān)督了這項研究，赫伯特歐文綜合癌癥中心醫(yī)學助理教授。

“利用冷凍樣本開展工作的能力為多機構合作打開了大門，這將推動生物標志物和藥物靶標的發(fā)現(xiàn)。它還讓我們有機會應用尖端計算技術來分析和整合未鎖定的臨床數(shù)據(jù)”阿齊茲解釋道。

Izar 補充說：“而且因為我們的方法只需要少量的組織，所以樣本的剩余部分可用于其他研究。這對研究人員、臨床醫(yī)生以及最重要的是我們的患者來說確實是雙贏的。”

標簽： 研究人員 哥倫比亞 新鮮組織